自贸区挂牌以来，南沙深入贯彻落实习近平总书记对自贸区、雄安新区和香港回归20周年重要指示和讲话精神，切实把思想和行动统一到习近平总书记重要指示和讲话精神上来，把工作重点转到全力落实省委、市委决策部署上来，认真总结经验，查找短板弱项，崇尚实干、锐意进取，着力推进自贸区南沙片区建设。截至目前，已累计形成289项改革创新成果，其中19项在全国复制推广，74项在全省复制推广，124项在全市推广实施，“跨境电子商务监管模式”、“企业专属网页政务服务新模式”入选商务部“最佳实践案例”。
据统计，今年自贸区内1-9月合同外资金额27.84亿美元，增长38.9%；实际利用外资金额3.63亿美元，增长19.8%；新设企业11163家、新增注册资本1564亿元，注册资本1亿元以上的企业达181家；认定全球、区域或海外总部数6个；世界500强企业入驻数量14个，世界500强投资企业数量24个；世界500强投资企业注册资本总额232.52亿元。
目前，南沙已开通83条国际航线、31条内贸航线和56条“穿梭巴士”支线，建成31个无水港，与40个国际港口建立了友好合作关系；今年1-8月完成904.15万标箱，同比增长15.39%；汽车码头年吞吐量超过55万台；国际邮轮旅客年进出港量超过32万人次，稳居全国第三。
今年1-8月，南沙保税港区进出区货值545亿美元；跨境电子商务累计进境电子清单1408.6万票，保税跨境电商进口38.6亿元，增长1.3倍，占广州市跨境电商进口值的50.5%；完成备案的跨境电商企业1252家，备案商品30万种。1-9月，市场采购商品出口集拼货值65亿美元，引导推动“旅游购物”业务向“市场采购”方式转型。
借鉴上海以及国际一流自由贸易港区建设经验，研究制定南沙自由贸易港建设方案，探索实施国际中转“零报关”措施，加快国际中转和离岸贸易发展。依托保税港区后方用地，建设集展示、交易、物流、金融于一体的外贸综合服务平台。争取百亿级交易额的广州国际种业交易中心和广州南沙塑料交易中心年内获批。
数读：
已落户港澳投资企业1060家 投资总额275.77亿美元
截至9月集聚融资租赁企业353家 累计业务合同余额超1500亿元
南沙港区已建成16个10—15万吨级集装箱泊位 2016年实现货物吞吐量3.04亿吨 集装箱吞吐量1262万标箱
航运物流企业累计达4357家
截至到10月底南沙出入境邮轮106艘次
出入境邮轮旅客35.12万人次